Сможет ли троян после фоматирования первого диска перейти на второй а после установки винды работать также как и работал

На втором только игры винды нету

Нет троян не может перемещайся между дисками

Только

Он может в блок питания убежать от туда вообще фиг удалиш

После форматирования ни чего не сможет.

Когда думаешь что загрузчик операционки тот что с меню выбора установлен на том диске который форматируешь, потом выясняется то и так может быть, хотя стандартный форматировщик из винды даёт сбои поэтому он может просто не форматнуть в нужных местах, вряд ли это сыграет но кто знает. Ну или он запишется в bios. Ну или так как я помню в компе в вин7 в игре готике 2 настройки видеодрайвера за то, что была перезагрузка перенеслись с вин7 на xp, а в xp другой видеодрайвер под xp заставляя её выдать больше fps, а мат. Плата сбойная, то так и сделалось, а может это не драйвер, а особенность кеширования не ждущая подгрузки, а то именно за пробег по одному месту повторно в xp повышал fps, а с висты начиная это делать не требовалось то стало понятно что при желании могут переносится что-то. Но это редковато.

Если троян поселился на диске, то только диск менять,
форматирование стирает оглавление а не саму программу, ведь после форматирования можно восстановить что было на диске, а он ещё и между дисками ползает, пока один форматируешь, он на другой уползает, хитрый гад… ))

У меня было однажды: вроде идет прогресс форматирования, а индикатор HDD не горит. Это троян подставил себя в системе.
А так, снять HDD, на другом компе под учеткой без админских прав отформатировать низкоуровневым форматированием несколько раз. Или специальной программой за несколько проходов. Занять это может ну очень много времени.