Если удалить все данные с ЖД. Виндоус не сотрётся?

Очень важно.

Чем стирать хочешь и как?

Если системный диск трогать не будешь, там диск с например папку виндовс

Там вроде же два пункта:
1) с удалением данных
2) с форматированием диска, то есть удаление и винды. Но винда сама себя не удалит

Удалишь и Windows

Если Винда тоже на этом диске, то и она будет уничтожена. Но это из самой ОС не сделать.

Виндус из себя не даст удалить себя, ее можно удалить загрузившись с другой оси, ну и порушить тоже можно основательно