Есть ли в ОС Windows такая возможность, что при запуске ярлыка запускать другой файл помимо того, что привязан к ярлыку

Ситуация такая: не так давно узнал, как именно ставить пароль на папки (с помощью незамысловатого скрипта), сразу поместил ярлык папки и ярлык скрипта на рабочий стол и хочу сделать полную оптимизацию, так, чтобы при открытии ярлыка папки, открывался скрипт, с просьбой ввести пароль, а затем появлялась папка. Возможно ли это?

Нет

Ну в целом, да. Времена сейчас такие, что можно запрограммировать любое действие с любым файлом. Как это делать точно не знаю, но в интернете это быть должно.

Ну так зайди в свойства ярлыка и напиши там что угодно.